いろんな地域の人とフレンドになり、交流を深め、リモート交換に誘導するのが運営の狙いと思われます。
地域限定と直接書いてしまうと角が立つため、気候や地形に依存して出現する種族をいくつか出すことで、事実上の地域限定ポケモンを増やす目論見です。
実情はともかく、森林地帯に出るノノクラゲ、海岸沿いにしか出ないウミディグダ、そして乾燥地帯限定のスナヘビでそれぞれバランスは取れているということでしょう。